Acuinuga identifica como una prioridad en su estrategia empresarial el desarrollo y ejecución de proyectos de investigación en el ámbito general de la Producción Animal de especies acuáticas, y en particular en el entorno multinacional de la Unión Europea a través de los Programas Marco de I+D.
Entre los proyectos de investigación y desarrollo tecnológico llevados a cabo o que se encuentran en fase de ejecución, destacan: